Organisasi aktivitas MBKM yang dipilih dimulai dari perencanaan dan pelaksanaannya merupakan suatu organisasi yang berkompeten pada bidangnya, seperti:
1. ORBIT (Lembaga Orbit Feature Akademik)
2. Permata (PTKI-Kemenag) telah berubah menjadi Merpati
3. Permata Sari (BKS PTN Barat)
4. PT Samator
5. Pejuang Muda 2021
6. Google Bangkit dan Bangkit Academy 2023.
Berdasarkan enam organisasi MBKM yang ada, Prodi S1 Matematika FST UIN Suska Riau menggunakan tiga organisasi yakni ORBIT, Merpati dan Permata Sari.